v0.1 — Research Use Only · Gratuit · SDK ouvert

La plateforme modulaire pour
l'analyse clinique
des variants génétiques.

Une plateforme modulaire qui unifie le chargement, la visualisation et la prédiction sur vos données VCF. Niveau Community gratuit, tiers Pro/Team/Enterprise pour usage illimité.

Télécharger gratuitement Explorer le SDK

Installation en 2 minutes Windows · macOS · Linux Sans télémétrie

ClinVCF-OS · Data Viewer

sample_S7.vcf

All Pathogenic VUS

GENE VARIANT CLINVAR IMPACT

TP53 p.R175H Pathogenic HIGH

BRCA1 c.5266dupC Likely path. HIGH

KRAS p.G12D Pathogenic HIGH

EGFR p.T790M VUS MOD

APC c.3920T>A Benign LOW

PIK3CA p.H1047R Pathogenic HIGH

Notre philosophie

Une plateforme, pas un produit fermé.

ClinVCF-OS s'inspire du modèle Linux et de VS Code appliqué à la génomique clinique. Nous fournissons le socle. La communauté construit dessus.

Plateforme ouverte

Le noyau est gratuit à perpétuité. Le SDK est open source sous licence MIT. Vos données restent chez vous, aucune télémétrie cachée, aucun lock-in propriétaire.

Écosystème modulaire

Chaque fonctionnalité est un module indépendant. Activez ce dont vous avez besoin, développez le reste, partagez votre travail via le ClinStore.

Piloté par la communauté

Les modules réglementaires (DM/CE-IVD) relèvent de la responsabilité de leurs publieurs. Nous ne verrouillons ni le contenu, ni la créativité.

Pourquoi ClinVCF-OS

L'outillage génomique mérite un changement de modèle.

AUJOURD'HUI

Fragmenté et propriétaire.

Chaque laboratoire réinvente ses pipelines, cloisonné dans des solutions propriétaires coûteuses ou des scripts maison non maintenus.

Licences annuelles à 5 chiffres par poste
Formats de données verrouillés, pas d'interopérabilité
Modules ML impossibles à auditer ou personnaliser
Mises à jour opaques, roadmap dictée par le vendeur

AVEC CLINVCF-OS

Ouvert et composable.

Un socle robuste et gratuit. Des modules que vous choisissez, installez, ou développez. Une communauté qui capitalise collectivement.

Plateforme gratuite à perpétuité · SDK open source
Formats standards (VCF, CSV, TSV) — aucune dépendance
Modules ML transparents, poids pré-entraînés ou custom
Roadmap publique, contributions bienvenues

L'écosystème de modules

Des outils distincts, une expérience unifiée.

ClinVCF-OS livre deux modules système gratuits. Nos modules premium comblent les besoins récurrents des équipes, et le SDK vous permet d'en développer d'autres.

Système Gratuit

VCF Loader

fdevelopment.eu/clinVCF/loader

Chargement, validation et normalisation de fichiers VCF, GVCF et BCF. Auto-détection du format, contrôle syntaxique, extraction des métadonnées.

Support VCF 4.0 → 4.5, GVCF, BCF
Mapping automatique des colonnes sources
Gestion fichiers multi-gigabytes

Système Gratuit

Data Viewer

fdevelopment.eu/clinVCF/viewer

Visualisation interactive. Filtres par colonne (contient, plage, expression), tri, réorganisation, export TSV/CSV, bibliothèque intégrée.

Filtres numériques avancés (expressions ≥, ≤, between)
Mapping sémantique Gene / Variant / ClinVar / Impact
Export vers bibliothèque locale ou emplacement libre

Inclus

PredSoma

fdevelopment.eu/clinVCF/predsoma

Scoring somatique tumoral avec classification AMP en 4 tiers (I-IV), oncogénicité, détection des hotspots OncoKB, calibration VAF/cellularité, support FFPE.

Classification AMP automatique (Tier I → IV)
Rapport exportable HTML / PDF / JSON
5 rapports/mois en Community (filigrané)

Inclus 5 rapports/mois en Community · illimité Pro+

Inclus

PredConst

fdevelopment.eu/clinVCF/predconst

Classification ACMG des variants constitutionnels (germinal). Calcul du score, attribution des critères PVS1/PS1/PM1/PP1…, classification automatique en 5 niveaux (Pathogène → Bénin).

Classification ACMG automatique 5 niveaux
Critères pondérés et traçables
5 rapports/mois en Community (filigrané)

Inclus 5 rapports/mois en Community · illimité Pro+

Votre module, ici.

Le SDK ClinVCF expose un manifeste simple, une API Python et une surface QML. Publiez votre module en quelques jours, vendez-le sur le ClinStore.

Consulter la documentation développeur

Le ClinStore

Un marketplace pensé pour les créateurs.

Distribuez vos modules auprès de laboratoires dans le monde entier. Nous gérons le paiement, les licences et les mises à jour.

Développeurs

Construisent des modules avec le SDK Python + QML.

.cvf

ClinStore

Distribution sécurisée, signatures vérifiées, mises à jour automatiques.

install

Laboratoires

Installent les modules en un clic depuis l'app.

80% / 20%

80% reviennent au développeur du module · 20% financent la plateforme et le paiement

Pour les développeurs

Publiez votre module en un après-midi.

Un manifeste JSON. Un point d'entrée QML ou Python. Un package .cvf. C'est tout ce qu'il faut pour distribuer un module sur le ClinStore.

i.
Manifeste déclaratif Un fichier manifest.json décrit votre module : id, version, entrée, permissions, icône.
ii.
API Python & bridge QML Accédez aux données VCF, à la bibliothèque utilisateur, aux services ML via des interfaces typées.
iii.
Sandbox et isolation Chaque module tourne dans son propre contexte. Pas de conflit entre modules, pas de données qui fuient.
iv.
Publication en un clic Empaquetez en .cvf, signez, téléversez vers le ClinStore. Paiements gérés pour vous.

manifest.json clinvcf · sdk

{
  "id": "mylab.variant_classifier",
  "name": "Variant Classifier Pro",
  "version": "1.2.0",
  "publisher": "MyLab Genomics",
  "description": "ACMG-based classifier",
  "entry": "qml:main.qml",
  "icon": "assets/icon.png",
  // APIs requested
  "apis": [
    "vcf.read",
    "library.write",
    "ml.predict"
  ],
  "requires": {
    "clinvcf_os": ">=0.1.0",
    "platforms": ["win", "mac", "linux"]
  }
}

Tarification

Gratuit pour commencer. Payant quand ça crée de la valeur.

Le noyau de ClinVCF-OS est gratuit à perpétuité. Les forfaits payants débloquent l'accès aux modules premium développés par notre équipe et aux services entreprise.

Community

La plateforme complète, gratuite pour toujours.

Gratuit

Gratuit · Sans engagement

Noyau ClinVCF-OS complet
VCF Loader + Data Viewer
Bibliothèque locale illimitée
PredSoma + PredConst inclus (5 rapports/mois chacun, filigrané)
Accès au SDK et marketplace
Support communautaire (GitHub)

Télécharger

Le plus populaire

Pro

Pour les chercheurs et petites équipes.

€49€29/mois

🎁 Tarif early-adopter — gardé à vie pour les 50 premiers

Tout Community +
PredSoma + PredConst illimités, sans filigrane
Accès aux modules premium (PharmGx, …)
Export rapports HTML / PDF / JSON
Support prioritaire email (48h)

S'abonner — €29/mois

Team

Pour les laboratoires et équipes multi-postes.

€299€199/mois

🎁 Early-adopter · 5 sièges inclus · +€49 par siège

Tout Pro +
5 utilisateurs inclus
Bibliothèque partagée d'équipe
Gestion des accès & rôles
Support email (24h)

S'abonner — €199/mois

Enterprise

Pour les hôpitaux, CHU et structures régulées.

Sur devis

SLA personnalisé

Tout Team +
Déploiement on-premise
SLA 99,9% + support 24/7
Audit de sécurité & conformité
Support à la qualification CE-IVD

Nous contacter

Questions fréquentes

Clair dès le premier regard.

ClinVCF-OS est-il gratuit ?

ClinVCF-OS propose 4 niveaux de licence. Le tier Community est gratuit avec 5 analyses/mois. Pour des analyses illimitées, il faut souscrire un tier payant : Pro (€29/mois early-adopter), Team (€199/mois early-adopter, 5 sièges) ou Enterprise (sur devis). Le SDK qui permet de développer des modules tiers reste publié sous licence open-source MIT. Le code de l'application elle-même est propriétaire.

Puis-je l'utiliser pour du diagnostic clinique ?

Non. ClinVCF-OS est livré en Research Use Only (RUO). Il n'est pas un dispositif médical et n'est pas destiné à des usages diagnostiques. Si vous souhaitez développer un module certifié CE-IVD (ou FDA), c'est possible via le SDK — la conformité réglementaire relève du publieur du module.

Mes données VCF quittent-elles mon poste ?

Jamais par défaut. Le noyau et les modules système fonctionnent entièrement en local, sans télémétrie. Les modules premium qui effectuent des prédictions ML fonctionnent également localement avec les poids téléchargés. Vous restez en contrôle de vos données.

Sur quelles plateformes puis-je l'installer ?

Windows 10/11, macOS 12+, et les principales distributions Linux (Ubuntu, Debian, Fedora). L'application est construite avec PySide6 / Qt — une base native, réactive et cross-platform.

Comment développer et publier mon propre module ?

Un module est un dossier contenant un fichier manifest.json, un point d'entrée QML ou Python, et vos ressources. Vous empaquetez en .cvf (zip), signez, puis publiez sur le ClinStore. Nous prenons 30% sur les ventes payantes (standard de l'industrie).

Pourquoi PySide6 / QML et pas une app web ?

Performance sur gros fichiers VCF (plusieurs Go), intégration native avec le système de fichiers, et expérience utilisateur fluide sans dépendance à un navigateur. QML permet aux développeurs tiers d'écrire des interfaces riches avec un langage déclaratif accessible.

Le code source est-il accessible ?

Le SDK ClinVCF est entièrement open source sous licence MIT, hébergé sur GitHub — vous pouvez l'auditer, l'utiliser comme base pour vos propres modules, et contribuer à son évolution. Le noyau ClinVCF-OS, en revanche, est un logiciel propriétaire : son code source n'est pas public, mais son utilisation est libre et gratuite.

La plateforme modulaire pour l'analyse clinique des variants génétiques.